使用格点模型探究纤维形成的机制

利用穷举蒙特卡罗模拟，我们研究了作为温度和链数函数的格点模型中纤维形成的动力学和机制。虽然这些模型充其量只是多肽的粗略近似，但我们表明，被认为控制纤维组装的许多通用特征都存在于该玩具模型中。单体包含由三个字母（疏水、极性和带电）组成的八个珠子，在天然状态下采用紧凑构象。纤维组装的动力学分三个不同阶段发生。在每个阶段都有一系列级联事件将单体和寡聚体转化为有序结构。在第一个“爆发”阶段，形成大小不一的高流动性寡聚体。在第二阶段，向易聚集构象的转变发生在寡聚体内部。随着时间的推移，出现一个包含大部分链的优势簇。在最后阶段，易聚集构象的颗粒作为模板，较小的寡聚体或单体可以停靠在上面并转化为纤维结构。后期生长的总时间可以很好地用过饱和溶液结晶的 Lifshitz-Slyazov 生长动力学来描述。