控制多肽链纤维形成的因素

利用晶格模型，我们通过穷尽采样序列和构象空间，探索了决定多肽链聚集倾向的因素。纤维样结构的形态及其形成的时间尺度($\tau_{fib}$)取决于疏水相互作用和库仑相互作用之间的平衡。孤立蛋白质构象谱中易形成纤维的构象集合——即N$^*$结构——的群体规模是$\tau_{fib}$的主要决定因素。这一观察结果被用于通过穷尽探索序列空间来确定聚集序列，从而为全基因组搜索易聚集片段提供了基础。