蛋白质结构可设计性的起源
软凝聚态物质
2009-10-31 v2 材料科学
q-bio
摘要
我们从三个角度考察了2字母代码(H和P)晶格蛋白可设计性的决定因素。首先，天然结构是在所有可能的结构中被搜索，还是仅在最大紧凑结构中被搜索。其次，所用晶格是否为二分图。第三，链长度的效应，即单链上单体数的影响。我们发现，晶格结构的二分性不是决定可设计性的主要因素。我们的结果表明，当链长度足够长以致于由足够数量的单体构成疏水核心时，才会找到高度可设计的结构。
引用
@article{arxiv.cond-mat/9812316,
title = {The Origin of the Designability of Protein Structures},
author = {Rie Tatsumi and George Chikenji},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/9812316},
year = {2009}
}
备注
17 pages, 2 figures