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晶格模型杂聚物的可设计性

凝聚态物理 2009-11-07 v1 q-bio

摘要

蛋白质折叠具有高度的可设计性,即许多序列会折叠成相同的构象。在目前的工作中,我们推导出了一个 20 字母蛋白质晶格模型中可设计性的表达式,该表达式仅依赖于中心极限定理,其普适性超出了推导它所使用的简单模型。该表达式显示了对给定构象上最优序列折叠能量的指数依赖性,该能量是相对于构象相异结构的最低能量来衡量的,这一能量差构成了控制可设计性的唯一参数。因此,天然构象的可设计性与其折叠序列的稳定性密切相关。

关键词

引用

@article{arxiv.cond-mat/0105340,
  title  = {Designability of lattice model heteropolymers},
  author = {G. Tiana and R. A. Broglia and D. Provasi},
  journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0105340},
  year   = {2009}
}

备注

in press on Phys. Rev. E