利用晶格模型确定多肽链原纤维形成的决定因素

我们利用晶格模型，通过穷举采样序列和构象空间，探索了决定多肽链聚集倾向的因素。纤维样结构的形态及其形成的时间尺度($\tau_{fib}$)取决于疏水相互作用和库仑相互作用之间的微妙平衡。在单体构象谱中，易于形成原纤维的结构的种群程度是$\tau_{fib}$的主要决定因素。这一观察结果被用于通过穷举探索序列空间来确定易于聚集的共有序列。我们的结果为全基因组范围内搜索易于聚集的片段提供了基础。