理想化纤维形成过程一般特性的建模

许多不同的蛋白质通过基本构建单元的可逆添加，自聚集形成不可溶的纤维，并沿顶端生长。但除了这一共同原理之外，纤维形成的方式千差万别，存在多种中间形态，这些形态可通过物理化学条件或氨基酸序列的微小改变而重新组合。为绕开这种复杂性，本文将纤维形成的多方面现象还原为其针对线性纤维原型定义的最基本原理。通过分离平衡与动力学方面以及体外与体内条件，使用极简假设和工具对选定的通用特征（包括成核、延伸和构象招募）进行建模。这些还原论方法得以揭示已知的和新的基本原理，包括成核的动力学和平衡效应、延伸对成核的双重影响、对成核和纤维数量的动力学限制，以及体内通过免于降解而实现的复合物积累。同时指出了这些过程中被忽视的方面：纤维长度的指数分布可以通过多种模型重现，因为它仅归因于随机性。还提出，同一个术语“临界浓度”被用于不同的事物，分别涉及成核或延伸。