淀粉样纤维形成中饱和延伸的哈密顿动力学

延伸是淀粉样纤维生长中的基本过程，通常表现为纤维延伸速率与单体浓度之间的线性关系。然而，在高浓度区域常观察到亚线性依赖，这可由一种普适的饱和机制解释。本文中，我们通过类米氏（Michaelis-Menten）机制对饱和延伸过程建模，该机制由两个子步骤构成——单体与纤维末端的不特异性结合与解离，以及结合单体随后的构象变化以适配纤维结构。对于 A$\beta$40、$\alpha$-突触核蛋白等，典型饱和浓度被发现为 $7-70\mu M$。此外，通过使用一种新颖的哈密顿表述，我们构建了在弱饱和与强饱和条件下均成立的解析解，并将其应用于 $\alpha$-突触核蛋白与丝素蛋白的纤维化动力学。