描述非对称反馈模块动力学的类型依赖随机 Ising 模型
概率论
2016-03-08 v3 数学物理
math.MP
分子网络
摘要
我们研究了一种对生物反馈环动力学行为建模的替代方法，即一种类型依赖的自旋系统，这类随机模型由 Fernández 等人(2009)引入，由于考虑了基因表达的内在变异性而很有用。我们分析了作为 repressilator（首个合成生物振荡器，由 Elowitz 和 Leibler (2000)发明）扩展的非对称反馈模块。我们考虑了类型依赖 Ising 模型的均值场动力学，然后研究了表示分子浓度的经验磁化强度向量。我们应用了从随机跳跃过程到确定性轨迹的收敛结果，并对相关动力系统进行了分岔分析。我们表明，所研究的非对称模块可以展现出非常丰富的行为，包括由 repressilator 描述的经验振荡。
引用
@article{arxiv.1504.04520,
title = {Type-dependent stochastic Ising model describing the dynamics of a non-symmetric feedback module},
author = {Manuel González-Navarrete},
journal= {arXiv preprint arXiv:1504.04520},
year = {2016}
}
备注
21 pages, 5 figures. To appears in Mathematical Biosciences and Engineering