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用于组织病理学图像表示的斑块聚类

泛函分析 2020-02-19 v3

摘要

全切片成像(WSI)在过去十年中已成为重要课题。尽管医学图像处理与计算资源均取得显著进展,WSI 中仍有问题尚待解决。一大挑战是扫描尺寸。数字化组织样本的维度可能超过 100,000 × 100,000 像素,给实时处理带来内存与效率障碍。本工作的主要贡献是通过选取少量斑块进行算法处理(如索引与检索)来表示 WSI。结果我们将检索时间与存储降低了 50%90%50\% - 90\% 不等的倍数,而斑块检索准确率仅损失几个百分点。我们对 KimiaPath24 数据集的局部二值模式(LBP)与深度特征应用了自组织映射(SOM)以聚类具有同类特征的斑块。我们使用高斯混合模型(GMM)以相当小(10%50%10\%-50\%)的斑块比例表示每个类别。结果表明 LBP 特征可优于深度特征。在 SOM 聚类与 GMM 斑块选取后仅选取 50%50\% 的斑块,我们获得了最佳匹配检索 65%65\% 的准确率,而最大准确率(使用所有斑块)为 69%69\%

关键词

引用

@article{arxiv.1903.07012,
  title  = {Sobolev spaces and trace theorem on the Sierpinski gasket},
  author = {Shiping Cao and Hua Qiu},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1903.07012},
  year   = {2020}
}

备注

We have refined another paper arXiv:1904.00342 very recently. The new version of that paper is written in a more general setting, and can cover all the results obtained in this paper. So it seems that this paper would have no reason to exist