罕见抗性突变下获救种群的位点频谱
概率论
2023-04-25 v2
摘要
本文旨在研究在治疗压力下，抗性获得对细胞种群中中性突变分布的影响。细胞种群由双类型分支过程建模。初始时所有细胞均为类型 0，对应负增长率。朝向类型 的突变假设为罕见且随机的，并导致细胞在治疗下存活，即类型 对应正增长率，从而建模抗性的获得。细胞还携带中性突变，在出生时发生并通过遗传累积，不影响其类型。我们描述了“位点频谱”（Site Frequency Spectrum, SFS）的期望，SFS 是种群中中性突变分布的指标，在抗性获得罕见事件和初始种群规模很大的渐近下。确切地说，我们给出了被少量和大量细胞共享的中性突变期望数的渐近等价表达式。为识别亲属对 SFS 的影响，我们的工作也引导我们详细研究亚临界二叉 Galton-Watson 树，其中每个叶节点以小概率被标记。作为该研究的副产品，我们从而给出了此类 Galton-Watson 树中以标记数为条件的随机选取叶节点代数的分布。
引用
@article{arxiv.2303.04069,
title = {Site frequency spectrum of a rescued population under rare resistant mutations},
author = {Céline Bonnet and Hélène Leman},
journal= {arXiv preprint arXiv:2303.04069},
year = {2023}
}