中性网络上的演化加速了分子钟的 ticking rate
种群与进化
2015-02-18 v2 统计力学
摘要
由于表型表达具有高度冗余性，大量基因型会产生相同的表型。因此，只要基因型突变为同一集合中的另一个基因型，种群即可在不改变其表型的情况下接受突变。通过连接每一对可通过突变相互访问的基因型，基因型将自身组织成中性网络（NN）。已知这些网络具有异质性和同配性，这些特性影响种群的演化动力学。通过研究具有任意拓扑结构的中性网络上种群的动力学，我们分析了同配性、中性网络（表型）适应度以及网络规模的影响。我们发现，种群离开网络的概率随着在网络中停留时间的延长而减小。这种渐进的“表型囚禁”导致过程的过离散程度随时间系统性增加，并加速了中性突变的固定率。我们还量化了这些效应随表型规模及其相对于邻近替代方案适应度的变化。
引用
@article{arxiv.1307.0968,
title = {Evolution on neutral networks accelerates the ticking rate of the molecular clock},
author = {Susanna Manrubia and José A. Cuesta},
journal= {arXiv preprint arXiv:1307.0968},
year = {2015}
}
备注
31 pages, 4 figures