人工演化调控网络的超网络

我们在基因型和表型空间的背景下研究超网络，具体情境为一个布尔图模型种群在针对短动力学吸引子的选择下演化而成。我们将图的邻接矩阵定义为其基因型，它在演化过程中发生突变，而其表型则是其动力学吸引子集合。基因型空间和表型空间中的超网络分别由遗传邻近性和表型相似性形成，后者由共享吸引子的吸引盆大小加权。我们发现，演化网络种群在基因型空间中形成巨大簇，具有泊松度分布，但表现出层次化组织的 $\kappa$-核分解。尽管如此，在大规模下，它们形成树状扩张图。随机布尔图种群通常在遗传上彼此相距甚远，无法形成超网络。在表型空间中，演化种群的超网络在消除弱连接和随机移除节点下均表现出超强的鲁棒性。