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重组对遗传鲁棒性中性进化的影响

种群与进化 2008-04-22 v1

摘要

传统群体遗传学考虑的是对应于不同适应度表型的有限数量基因型的进化。然而,随着特定模型表型(特别是 RNA 二级结构)在计算上变得可行,人们已经明显认识到,突变的上下文依赖效应以及这些基因型 - 表型映射中固有的多对一性质可能产生根本性的进化后果。此前已有研究表明,仅通过中性突变在对应于具有相同二级结构的所有基因型的中性网络上进化的基因型群体,可以通过将群体集中在高中性度区域来进化出突变鲁棒性 [Nimwegen 等人,Mutational robustness 的中性进化,1999 PNAS]。引入重组后,我们通过数值计算无限群体在随机中性网络集合上的稳态分布,证明了突变鲁棒性显著增强,并且这种增强的幅度对中性网络拓扑的细节敏感。通过对在随机中性网络和缩微 microRNA 中性网络上进化的有限基因型群体进行模拟,我们表明即使在有限群体中,重组仍会促使群体集中在局部高中性度区域。

关键词

引用

@article{arxiv.0804.3279,
  title  = {The Effect of Recombination on the Neutral Evolution of Genetic Robustness},
  author = {Gergely J. Szollosi and Imre Derenyi},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0804.3279},
  year   = {2008}
}

备注

Accepted for publication in Math. Biosci. as part of the proceedings of BIOCOMP 2007