大型兼性有性种群中的遗传牵引与准中性
种群与进化
2011-08-09 v1
摘要
大型种群可能包含大量同时分离的、受自然选择影响的多态性。由于选择作用于其适应度依赖于多个位点的个体，不同位点会相互影响彼此的动态。这导致等位基因频率的随机波动超出遗传漂变的范畴——这种效应被称为遗传牵引。由于重组会打破等位基因间的关联，当重组稀少时，牵引效应很强。在此，我们研究一个兼性异交种群，其异交和重组频率r相对于适应度差异的特征尺度σ较小。在这种情形下，适应基因型通过克隆扩张，导致重组后代基因型数量出现大幅波动。后者分布的幂律尾部使得无法用有效中性模型来捕捉牵引的动态。相反，我们发现中性等位基因的固定时间仅随种群规模缓慢增加，但敏感地依赖于比值r/σ。选择的效力显著降低，即使对于Ns>>1，只要|s|<s_c，等位基因也表现出“准中性”行为，其中s_c强烈依赖于r/σ，但仅微弱依赖于种群规模N。此外，由牵引引起的异常涨落将（准）中性等位基因的频谱从对应漂变的f(ν)∼1/ν改变为∼1/ν²。最后，牵引加速了通过有害中间步骤的两步适应速率。
引用
@article{arxiv.1108.1635,
title = {Genetic Draft and Quasi-Neutrality in Large Facultatively Sexual Populations},
author = {Richard A. Neher and Boris I. Shraiman},
journal= {arXiv preprint arXiv:1108.1635},
year = {2011}
}
备注
Includes supplement as appendix