RNA中性网络进化搜索中的新结构变异

RNA二级结构是一个重要的计算模型，用于理解遗传变异如何映射为表型（结构）变异。RNA结构中的进化创新由中性网络促进，即折叠为相同结构的大型连通RNA序列集合。我们的工作扩展并深化了先前关于中性网络的研究。首先，我们表明即便给定序列（基因型）G0及其结构（表型）P的1-突变邻域，也包含许多与P不相近的结构变异。这对生物学RNA序列和通用RNA序列均成立。其次，我们分析了距G0仅有中等汉明距离k的基因型Gk的1-邻域中的新结构，与G0本身结构之间的关系，分别针对生物学和通用RNA结构。第三，我们分析了序列的突变鲁棒性与该序列附近结构变异距离之间的关系。我们的发现强调了中性网络在进化创新中的作用，以及高鲁棒性在削弱此类创新潜力方面可能发挥的作用。