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let-7 miRNA 序列-结构对的遗传稳健性

种群与进化 2018-01-17 v1 组合数学

摘要

遗传稳健性,即已演化表型在基因型突变下的保持,是进化中的核心概念之一。近年来大量工作聚焦于广泛生物系统中稳健性的起源、机制和后果。特别地,针对非编码 RNA(ncRNA)的研究考察了序列在单点突变下维持折叠结构的能力。在这些研究中,结构仅作为参考。然而,近期工作揭示了结构本身有助于 ncRNA 遗传稳健性的证据。我们遵循这一思路,将序列-结构对视为进化单元,并引入逆折叠率谱(IFR-spectrum)作为遗传稳健性的度量。我们对 let-7 miRNA 家族的分析捕捉了结构调制进化的关键特征,并促进了针对多点突变稳健性的研究。

关键词

引用

@article{arxiv.1801.05056,
  title  = {Genetic robustness of let-7 miRNA sequence-structure pairs},
  author = {Qijun He and Fenix W. Huang and Christopher Barrett and Christian M. Reidys},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1801.05056},
  year   = {2018}
}

备注

9 pages 7 figures