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microRNA中遗传稳健性与环境稳健性的协同进化

种群与进化 2009-01-25 v2 软凝聚态物质 生物物理 生物大分子 基因组学

摘要

遗传稳健性,即在突变面前保持最优表型的能力,对于理解进化至关重要,因为表型表达的遗传变异是自然选择的燃料。然而,遗传稳健性的起源——它是直接通过自然选择进化而来,还是其他表型性状的相关副产物——尚未得到解决。通过检查几个真核物种的microRNA (miRNA) 基因,Borenstein和Ruppin (Borenstein et al. 2006, PNAS 103: 6593) 表明,与具有相同茎环结构的随机RNA序列样本相比,miRNA前体茎环的结构表现出显著增强的突变稳健性。观察到的稳健性被发现与传统的环境稳健性度量不相关——这意味着miRNA序列显示了遗传稳健性直接进化的证据。这些发现令人惊讶,因为理论结果表明,稳健性的直接进化需要高突变率和/或大的有效种群规模,这仅在RNA病毒中发现,而非多细胞真核生物。通过引入一种基于miRNA前体序列二级结构平衡热力学系综的环境稳健性新度量,我们证明了RNA折叠的生物物理学在遗传(突变)稳健性和环境(热力学)稳健性之间诱导了高水平的相关性,正如Ancel和Fontana (Ancel et al. 2000, J. Exp. Zool. 288: 242) 引入的质体遗传协同理论所预期的那样。基于理论考虑,我们认为这种相关性强烈表明,在miRNA序列中观察到的遗传稳健性是选择环境稳健性的副产物。

关键词

引用

@article{arxiv.0810.2658,
  title  = {Congruent evolution of genetic and environmental robustness in microRNA},
  author = {Gergely J. Szöllősi and Imre Derényi},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0810.2658},
  year   = {2009}
}

备注

Accepted for publication in Mol. Biol. Evol. Supplemental Information available as a separate pdf file from http://angel.elte.hu:/~ssolo/miRNA_supp_mat.pdf