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中性网络和玩具适应度景观上进化动力学中的种群大小效应

种群与进化 2009-11-13 v2 统计力学

摘要

我们研究了在选择性压力下,在RNA中性网络或玩具适应度景观上进化的种群动力学。我们讨论了稳态下种群的扩散和中性。根据选择或随机漂变哪个占主导,会出现不同的极限。在强漂变存在的情况下,我们表明可观测量主要依赖于MμM \mu,其中MM是种群大小,μ\mu是突变率,而对此标度的修正按1/M进行:如果适应度景观中存在障碍,在存在选择的情况下,这种修正可能相当大。我们还发现,向大MμM \mu极限的收敛是1/Mμ1/M \mu的线性函数。最后,我们引入了一种最小化漂变的协议;然后可观测量按1/M而不是1/(Mμ)1/(M\mu)标度,这使得当μ\mu较小时可以更快地确定大MM极限;此外,基因型多样性从O(lnM)O(\ln M)增加到O(M)O(M)

关键词

引用

@article{arxiv.q-bio/0610034,
  title  = {Population size effects in evolutionary dynamics on neutral networks and toy landscapes},
  author = {Sumedha and Olivier C Martin and Luca Peliti},
  journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0610034},
  year   = {2009}
}

备注

25 Pages, replaced with revised version,submitted to J Stat