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化学反应网络的中性理论

统计力学 2012-03-22 v3 化学物理 分子网络

摘要

化学反应网络的特征在多大程度上反映了其目的和功能?通常,人们认为特定特征与特定功能之间的相关性是理解复杂结构的关键。然而,特定特征有时可能是中性的,与任何系统特定的目的、功能或因果链无关。这些中性特征是由偶然性和随机性引起的。在这里,我们比较了两类化学网络:一类经受了生物进化(活细胞中代谢的化学反应网络),另一类没有(大气行星化学反应网络)。结果表明,它们的度分布共享相同的中性、独立于系统的特征。宽分布的形状在很大程度上由单个参数——网络大小——控制。从这个角度来看,大气网络和代谢网络之间几乎没有区别;它们只是同一随机组装网络的不同大小。换言之,度分布的形状是一个中性特征,本身没有功能或进化意义;这不是生死攸关的问题。

关键词

引用

@article{arxiv.1112.3803,
  title  = {Neutral theory of chemical reaction networks},
  author = {Sang Hoon Lee and Sebastian Bernhardsson and Petter Holme and Beom Jun Kim and Petter Minnhagen},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1112.3803},
  year   = {2012}
}

备注

13 pages, 8 figures