化学反应网络的有效动力学

化学反应网络理论是描述和分析化学系统的有力框架。虽然平衡态下的浓度分布很大程度上可由图结构确定，但整体反应的时间演化取决于网络的动力学速率函数。在本文中，我们考虑将化学反应网络视为从进料物种到产物的转化系统时的有效动力学问题。我们将有效动力学定义为由化学反应网络确定的非自治常微分方程组的部分解。实际计算的例子包括 Michaelis-Menten 机制，证实了我们的有效动力学概念能得出经典公式。此外，我们引入了非自治常微分方程的直线解概念，以形式化存在明确定义的反应速率的情形，并考虑其与微观动力学中使用的准稳态近似的关系。此处的考量为制定化学反应网络的反应速率提供了一个统一框架。