基因组DNA的熔解：基于非线性晶格动力学的预测建模
生物物理
2012-02-20 v2 统计力学
生物大分子
摘要
在基于非线性晶格动力学的Peyrard-Bishop-Dauxois（PBD）模型框架内，研究了长异质DNA链的熔解行为。利用pBR322质粒和完整T7噬菌体的数据获得了模型拟合，并确定了参数对盐浓度的依赖性。在没有任何可调参数的情况下，预测的完整fd噬菌体以及φX174噬菌体的Y1和Y2片段的熔解曲线与实验吻合良好。计算出的单碱基对打开概率与从亚胺质子交换实验中获得的值一致。
引用
@article{arxiv.1007.2728,
title = {Melting of genomic DNA: predictive modeling by nonlinear lattice dynamics},
author = {Nikos Theodorakopoulos},
journal= {arXiv preprint arXiv:1007.2728},
year = {2012}
}
备注
5 pages, 4 figures, to appear in Phys. Rev. E