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碱基对开放与 DNA 柔韧性的温度依赖性

统计力学 2012-02-20 v2 软凝聚态物质 生物物理 生物大分子

摘要

研究了碱基对开放与 DNA 柔韧性之间的关系。两个不同小组发表的关于持久长度温度依赖性的实验数据,可以通过一个具有软硬关节的非均匀 Kratky-Porod 模型得到很好的描述,其中软硬关节分别对应开放和闭合的碱基对;而关于每个碱基对状态的序列依赖性统计信息则由无自由可调参数的 Peyrard-Bishop-Dauxois (PBD) 模型计算提供。

关键词

引用

@article{arxiv.1201.6561,
  title  = {Base Pair Openings and Temperature Dependence of DNA Flexibility},
  author = {Nikos Theodorakopoulos and Michel Peyrard},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1201.6561},
  year   = {2012}
}