具有溶剂势垒的DNA模型的热力学与力学性质
生物物理
2010-09-29 v1 生物大分子
摘要
我们在介观Peyrard-Bishop-Dauxois模型框架下，通过引入溶剂相互作用，研究了DNA变性的热力学与力学行为。通过分析均质A-T序列的熔解转变，我们能够设定模型的合适参数值，并研究系统中气泡的形成与稳定性。然后，我们聚焦于P5启动子序列的情况，并使用轨迹的主成分分析来提取系统动力学行为的主要信息。我们发现这种分析方法与先前的生物学结果高度吻合。
引用
@article{arxiv.1009.1501,
title = {Thermal and mechanical properties of a DNA model with solvation barrier},
author = {Rafael Tapia-Rojo and Juan J. Mazo and Fernando Falo},
journal= {arXiv preprint arXiv:1009.1501},
year = {2010}
}
备注
Physical Review E (in press)