Cavendar-Farris-Neyman模型下1级系统发生网络的不变式
种群与进化
2021-02-09 v1 代数几何
摘要
系统发生网络能够建模树木无法捕捉的更复杂的进化现象，如水平基因转移与杂交。用于建模树上进化的相同马尔可夫模型也可扩展至网络，并可提出类似问题，如网络参数的可辨识性或模型的不变式。本文聚焦于寻找1级系统发生网络在Cavendar-Farris-Neyman（CFN）模型下的不变式。我们通过将问题归约为寻找sunlet网络的不变式来实现，sunlet网络是由单个环及每个顶点上的叶组成的1级网络。随后我们确定了sunlet网络理想中的所有二次不变式，并猜想其生成了整个理想。
引用
@article{arxiv.2102.03431,
title = {Invariants for level-1 phylogenetic networks under the Cavendar-Farris-Neyman Model},
author = {Joseph Cummings and Benjamin Hollering and Christopher Manon},
journal= {arXiv preprint arXiv:2102.03431},
year = {2021}
}
备注
29 pages, 6 figures