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基于基因树四分体的1级物种网络可识别性

种群与进化 2024-01-15 v1 统计理论 统计理论

摘要

当发生杂交或其他形式的水平基因转移时,物种间的进化关系用系统发育网络表示比用树表示更好。虽然此类网络的推断仍具挑战性,但最近提出的几种方法基于四分体一致性因子——即从物种中采样的基因所关联的树显示出可能的4分类单元关系的概率。在早期结果的基础上,我们研究了在网络多物种合并模型下,从一致性因子中可以识别出哪些1级网络特征。我们获得了关于网络拓扑特征和数值参数的结果,揭示了与网络中3环相关的若干可识别性失效问题。

关键词

引用

@article{arxiv.2401.06290,
  title  = {Identifiability of Level-1 Species Networks from Gene Tree Quartets},
  author = {Elizabeth S. Allman and Hector Baños and Marina Garrote-Lopez and John A. Rhodes},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2401.06290},
  year   = {2024}
}

备注

27 pages + 11 pages Supplementary Materials