在概率性重组-突变进化模型下树-子系统发育网络的可辨识性
种群与进化
2018-03-28 v1 概率论
摘要
系统发育网络是系统发育树的扩展，用于表示发生过网状事件（如重组和杂交）的进化历史。此类网络的一个核心问题即可辨识性，其本质上追问在何种情况下我们能够可靠地识别产生观测数据的系统发育网络？近来，相对于一种推广了系统发育树所用标准马尔可夫模型的序列进化模型，已出现了针对网络的可辨识性结果。然而，这些结果就所考虑网络的复杂性而言相当有限。在本文中，通过引入一种基于 Thatte 在系谱方面开创性工作的沿网络进化的替代概率模型，我们能够获得针对远大类系统发育网络（本质上是所谓树-子网络类）的可辨识性结果。为证明我们的主定理，我们推导了一些用于组合地识别树-子网络的新结果，然后改编 Thatte 为系谱开发的一些技术，以表明我们的组合结果意味着概率设定下的可辨识性。我们希望新网络模型的引入能催生可靠构建系统发育网络的新途径。
引用
@article{arxiv.1712.04223,
title = {Identifiability of tree-child phylogenetic networks under a probabilistic recombination-mutation model of evolution},
author = {Andrew Francis and Vincent Moulton},
journal= {arXiv preprint arXiv:1712.04223},
year = {2018}
}
备注
18 pages, 4 figures