超越水平-1：Galled 树-子网络的可辨识性
种群与进化
2025-05-01 v1
摘要
基因组时代推断 phylogenetic 网络的意义日益增加。然而，尽管其在证明方法中起着关键作用，phylogenetic 网络从各种数据类型可辨识性仍不为人所了解。本文为大型 galled 树-子半有向网络子类获得了强可辨识性结果。我们的证明要求的某些条件，如网络树状块的可辨识性或 4 个 Taxa 在水平-1 网络循环中的圆顺序，已知在许多数据类型下成立。我们表明，这些条件对四谱共轃因子数据在各种基因树模型下均成立，使我们得以获得来自每个 Taxa 2 个以上样本的最强结果。虽然我们考虑的网络类别具有拓扑限制，但包括任意水平的非平面网络，远远超过水平-1 网络——唯一已知从许多数据类型可辨识的网络类别。我们的工作为从其他数据类型对树-子 galled 网络证明未来可辨识性 establish 了一条路线，通过检查是否满足明确的条件。
引用
@article{arxiv.2504.21116,
title = {Beyond level-1: Identifiability of a class of galled tree-child networks},
author = {Elizabeth S. Allman and Cecile Ane and Hector Banos and John A. Rhodes},
journal= {arXiv preprint arXiv:2504.21116},
year = {2025}
}
备注
23 pages