基于马尔可夫过程所生成数据区分一级系统发育网络
种群与进化
2021-07-08 v3
摘要
系统发育网络能够表示无法用系统发育树描述的进化事件。这些网络能够纳入网状进化事件，如杂交、渐渗和水平基因转移。近来，基于网络的 DNA 序列进化马尔可夫模型已被提出，同时出现了基于模型的系统发育网络重建方法。为使这些方法具有一致性，网络参数需要能从模型下生成的数据中辨识。在此，我们证明：在 Jukes-Cantor、Kimura 2-parameter 或 Kimura 3-parameter 约束下，具有任意固定数量网状顶点且无三角形的、一级半有向网络模型的网络参数在一般意义下是可辨识的。
引用
@article{arxiv.2007.08782,
title = {Distinguishing level-1 phylogenetic networks on the basis of data generated by Markov processes},
author = {Elizabeth Gross and Leo van Iersel and Remie Janssen and Mark Jones and Colby Long and Yukihiro Murakami},
journal= {arXiv preprint arXiv:2007.08782},
year = {2021}
}
备注
24 pages, 10 figures