一类生化反应网络基于少数物种的可辨识性
分子网络
2019-04-26 v2
摘要
在质量作用动力学下，生化反应网络产生多项式自治动力系统，其参数往往难以估计。本文处理一类丰富存在的生化网络（如多位点磷酸化系统和磷酸化级联（例如 MAPK 级联））的动力学参数辨识问题。对于该类的任意系统，我们显式地给出关联有向图每个连通分量的一个单一物种，使得其浓度的连续全导数允许我们辨识该分量中出现的所有参数。所需导数数量本质上由上确界有向图对应连通分量的长度界定。此外，在级联的特殊情形下，我们证明参数可从最后一层最后产物的有界个连续导数中辨识。该理论结果也导出了一种基于插值的启发式可辨识性程序，以从精确测量中恢复速率常数的值。
引用
@article{arxiv.1811.08336,
title = {Identifiability from a few species for a class of biochemical reaction networks},
author = {Gabriela Jeronimo and Mercedes Pérez Millán and Pablo Solernó},
journal= {arXiv preprint arXiv:1811.08336},
year = {2019}
}