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生物网络的模块化分解与分析

分子网络 2014-12-03 v1

摘要

本文探讨了将生化网络分解为功能模块的方法,这些模块在与其它模块互联时能保持其动态特性,从而允许从其组成模块的性质推断网络行为。此处开发的模块化分解方法还具有一个特性:化学反应参数的任何变化仅影响单个模块的动力学。为阐明我们的结果,我们定义并分析了基因调控、酶网络和信号通路中出现的几个关键生物模块。我们还提供了一系列示例,基于控制系统理论的结果,展示了如何从组成模块的性质推导生物网络的行为。

关键词

引用

@article{arxiv.1412.0742,
  title  = {Modular decomposition and analysis of biological networks},
  author = {Hari Sivakumar and Stephen R. Proulx and João P. Hespanha},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1412.0742},
  year   = {2014}
}

备注

Journal / technical report, 43 pages, 17 figures