利用 Hill 函数分解复杂化学网络的理论
生物物理
2015-01-21 v2 分子网络
摘要
从头设计和合成复杂且大型的模拟生化网络是合成生物学中一个尚未解决的问题。为解决这一局限性而不依赖临时性的计算和实验，需要一种预测性数学理论将这些复杂化学网络简化为自然的物理化学表达式。在此，我们提供了一种理论，该理论为几乎任意非线性且复杂的大型化学网络提供了物理化学表达式。出乎意料的是，该理论表明此类网络可以仅基于 Hill 方程（一种简单的化学逻辑门）分解为反应。该理论类似于计算机中实施的电气逻辑门或功能算法，被提议用于将受调控的功能化学反应序列（如模拟基因、转录调控、信号转导、蛋白质相互作用和代谢网络）实施到人工设计的化学网络中。
引用
@article{arxiv.1405.5621,
title = {A Theory of Decomposition of Complex Chemical Networks using the Hill Functions},
author = {Eisuke Chikayama and R. Craig Everroad},
journal= {arXiv preprint arXiv:1405.5621},
year = {2015}
}