关于化学反应网络重构的复杂性
计算复杂性
2013-09-30 v1 分子网络
摘要
分析化学反应网络的结构对于更好地理解化学过程至关重要。此类网络可以很好地描述为超图。然而，由于现有方法的限制，关于网络性质的分析通常是在从完整超图描述导出的标准图上进行的，例如所谓的物种图和反应图。然而，从这些图重构底层超图并不一定是唯一的。在本文中，我们解决了从其物种图和反应图重构超图的问题，并证明了该问题在其布尔公式化形式下的 NP 完全性。此外，我们在随机实例和真实世界实例上对该问题进行了实证研究，以调查其在实践中的计算极限。
引用
@article{arxiv.1309.7198,
title = {On the Complexity of Reconstructing Chemical Reaction Networks},
author = {Rolf Fagerberg and Christoph Flamm and Daniel Merkle and Philipp Peters and Peter F. Stadler},
journal= {arXiv preprint arXiv:1309.7198},
year = {2013}
}