基于条件图逻辑网络的逆合成预测
机器学习
2020-01-07 v1 机器学习
摘要
逆合成是有机化学中的基本问题之一。其任务是识别可用于合成指定产物分子的反应物。近来,计算机辅助逆合成正重新获得化学与计算机科学界的关注。多数现有方法依赖定义子图匹配规则的基于模板的模型,但化学反应能否进行并非由硬性决策规则定义。本文中,我们提出一种使用该任务的新方法——条件图逻辑网络(Conditional Graph Logic Network),一种构建于图神经网络之上的条件图模型,其学习反应模板中规则应何时被应用,隐式地考量所得反应在化学上是否可行且具有策略性。我们还提出一种高效的分层采样以缓解计算代价。在基准数据集上相较当前最先进方法取得 8.1% 的显著提升的同时,我们的模型还为预测提供了解释。
引用
@article{arxiv.2001.01408,
title = {Retrosynthesis Prediction with Conditional Graph Logic Network},
author = {Hanjun Dai and Chengtao Li and Connor W. Coley and Bo Dai and Le Song},
journal= {arXiv preprint arXiv:2001.01408},
year = {2020}
}
备注
NeurIPS 2019