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生化反应系统中的几何与对称性

组合数学 2021-09-24 v3 谱理论

摘要

细胞内生化反应的复杂系统在调控细胞身份与功能方面具有核心作用。生化反应系统通常使用图论的语言与工具进行研究。然而,图表示仅能描述分子物种之间的成对相互作用,因此并不适合对可能涉及众多反应物与/或产物的复杂反应集合进行建模。在此,我们利用一种新近发展的化学反应超图理论,该理论自然允许高阶相互作用,以探索生化反应系统中的几何结构并量化其功能冗余。我们的结果构成了有向超图自同构的一般理论,并描述了自同构群结构对超图拉普拉斯谱的影响。

关键词

引用

@article{arxiv.2010.01049,
  title  = {Geometry and symmetry in biochemical reaction systems},
  author = {Raffaella Mulas and Rubén J. Sánchez-García and Ben D. MacArthur},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2010.01049},
  year   = {2021}
}

备注

Theory in Biosciences, To appear