具有滤波功能的网络化酶逻辑门：新的理论建模表达式及其实验应用
分子网络
2013-12-17 v1 生物物理
摘要
我们报告了首个关于连接酶催化反应网络的研究，该网络加入了化学和酶过程，将最近开发的生化滤波步骤整合到该生物催化级联的功能中。推导了新的理论表达式，以便对此类级联中串联的网络组件进行简单的少参数建模，包括有无滤波的情况。将推导出的表达式与实验数据进行了对比测试，这些数据是通过光学测量获得的网络响应，反映了在有无滤波过程的情况下输入化学物质浓度的变化。我们还描述了当前的建模方法如何捕捉并解释了早期酶过程研究中识别出的若干观察结果和特征，当时这些过程被视为多步信息/信号处理系统的潜在网络组件。
引用
@article{arxiv.1312.4235,
title = {Networked Enzymatic Logic Gates with Filtering: New Theoretical Modeling Expressions and Their Experimental Application},
author = {Vladimir Privman and Oleksandr Zavalov and Lenka Halamkova and Fiona Moseley and Jan Halamek and Evgeny Katz},
journal= {arXiv preprint arXiv:1312.4235},
year = {2013}
}
备注
Keywords: binary AND; biocatalytic cascade; biochemical signals; multi-input biosensor