生化网络多参数分岔分析的反馈方法
分子网络
2007-11-20 v1
摘要
作为细胞信号通路基础的生化网络中的反馈回路是产生复杂行为的重要元素。其中一个特定方面是平衡点的稳定性如何依赖于模型参数。对于使用大量参数建模的生化网络，通常很难估计参数对稳定性的影响。寻找导致稳定性变化的参数是进行有意义分岔分析的关键步骤。我们描述了一种基于控制论中已知方法的方法，该方法可以定位导致稳定性变化的参数。该方法考虑生化网络中的反馈回路，并将稳定性属性与通过断环获得的控制系统联系起来。该方法以 MAPK 级联模型为例进行了应用说明。
引用
@article{arxiv.0711.2687,
title = {A feedback approach to bifurcation analysis in biochemical networks with many parameters},
author = {Steffen Waldherr and Frank Allgower},
journal= {arXiv preprint arXiv:0711.2687},
year = {2007}
}