时间序列进化分析中遗传漂变的评估
种群与进化
2016-11-21 v1
摘要
Wright-Fisher模型是描述有限种群大小进化系统行为的最常用种群模型。该模型的近似常被用于分析时间分辨的基因组序列数据，但模型本身很少针对基因组数据进行检验。在此，我们评估了在给定实验数据时，该模型在多大程度上能被推断为正确模型。给定来自进化实验的全基因组数据，我们验证了Wright-Fisher模型是有限种群方差的更好模型，与之对比的是等位基因频率传播的高斯模型。然而，我们注意到在一系列情况下无法正确识别Wright-Fisher模型。我们讨论了对Wright-Fisher模型进行更快速近似的潜力。
引用
@article{arxiv.1611.06152,
title = {Evaluating genetic drift in time-series evolutionary analysis},
author = {Nuno R. Nené and Ville Mustonen and Christopher J. R. Illingworth},
journal= {arXiv preprint arXiv:1611.06152},
year = {2016}
}