深拓扑打结蛋白质的共翻译折叠

即使在有利于形成天然接触但无拓扑偏置的结构模型中，深拓扑打结蛋白质的正确折叠成功率也极低。通过采用结构模型，我们证明了在模型核糖体上的共翻译折叠可以提高蛋白质 YibK 形成三叶结的概率，而无需引入任何非天然接触。核糖体被表示为不断延伸蛋白质的排斥壁。核糖体上的折叠通过滑结构象进行。我们阐明了其形成的力学与能量学。我们表明，核糖体上折叠的打结概率是温度的函数，并且该过程存在一个最优温度。我们的模型通常会导致天然接触的形成而不形成结。