纠缠蛋白中检测到的序列与结构模式揭示了共翻译折叠的重要性

蛋白质必须快速折叠以获得其具有生物功能的三个维度天然结构。因此，这些结构主要由局部接触稳定，而诸如纽结之类的复杂拓扑则很罕见。在此，我们揭示了蛋白质序列和结构为应对主链自纠缠所采用的特定模式。对蛋白质数据银行的大规模分析表明，与另一链段显著缠绕的环通常由弱结合氨基酸闭合。为何维持这种能量受阻？一种可能的情形是，纠缠环仅在折叠过程末期形成以避免动力学陷阱。一致地，这些环更频繁地被发现缠绕在其 N 端一侧的链段上，该侧在核糖体上翻译较早。最后，这些基序在天然状态中比在模拟的类蛋白结构中更少，但它们出现在 32% 的蛋白质中，其中某些情况显示出惊人的复杂缠绕。