从氨基酸序列读出三维蛋白质结构
凝聚态物理
2007-05-23 v2 q-bio
摘要
虽然蛋白质折叠所需的所有信息均包含在其氨基酸序列中，但迄今尚未掌握如何从序列中提取这些信息，以预测已知序列蛋白质的详细、生物活性的三维结构。这一局面尤为令人不满，因为一旦知道蛋白质的氨基酸序列就相对容易获得，而要确定折叠后的天然构象则必须通过在蛋白质晶体上进行复杂的 X 射线衍射分析，或对于 very 小的蛋白质则通过核磁共振技术实现。基于从小型蛋白质（不超过100个残基）的折叠格子模型仿真中获得的洞察——尤其是这种现象本质上由强相互作用氨基酸间的保守接触所控制，这些接触还稳定折叠过程中早期形成的局部基本结构，并在它们相互组装成为折叠核心——我们制定了一种成功的策略，从氨基酸序列中读取蛋白质的三维结构。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0005150,
title = {Reading the three-dimensional structure of a protein from its amino acid sequence},
author = {R. A. Broglia and G. Tiana},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0005150},
year = {2007}
}
备注
misprints eliminated and small mistakes corrected