蛋白质的离散微分几何:一种编码蛋白质三维结构的新方法
组合数学
2007-05-23 v1 离散数学
度量几何
基因组学
摘要
在自然界中,蛋白质的三维结构编码于相应的基因中。本文描述一种将蛋白质三维结构编码为二进制序列的新方法。该方法的特征在于蛋白质折叠与“积分”之间的对应。蛋白质被近似为折叠四面体序列。蛋白质的二进制编码作为折叠四面体序列形状的“二阶导数”获得。借助此方法,我们可从基因提取蛋白质的静态结构信息,并能在无任何主观层次分类的情况下描述蛋白质三维结构的分布。
引用
@article{arxiv.math/0506082,
title = {Discrete differential geometry of proteins: a new method for encoding three-dimensional structures of proteins},
author = {Naoto Morikawa},
journal= {arXiv preprint arXiv:math/0506082},
year = {2007}
}
备注
10 pages, 6 figures, 3 tables. Submitted