关于“蛋白质折叠时间的链长标度”，PRL 77, 5433 (1996) 的评论
统计力学
2009-10-30 v1 q-bio
摘要
在最近一封信中，Gutin、Abkevich 和 Shakhnovich (GAS) 报道了一系列关于蛋白质晶格模型的动力学蒙特卡洛模拟。基于这些高度简化的模型，他们发现四种不同势能导致四种不同的折叠时间尺度 tau_f，其中 tau_f 随链长标度为 N^lambda（另见参考文献[2-4]），lambda 从 2.7 变化到 6.0。然而，由于缺乏蛋白质折叠动力学的微观模型，数据的解释与起源仍有些推测性。本评论旨在指出，应用一个简单的蛋白质折叠“介观”模型（cond-mat/9512019, PRL 77, 2324, 1996）可完全解释其论文中呈现的数据。此外，我们发现与 GAS 的论证性解释存在主要定性分歧。包括动力学起源以及临界折叠核的大小。
引用
@article{arxiv.cond-mat/9701210,
title = {Comment on "Chain Length Scaling of Protein Folding Time", PRL 77, 5433 (1996)},
author = {Carlos J. Camacho},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/9701210},
year = {2009}
}
备注
1 page Revtex, 1 fig. upon request. Submitted to PRL