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推断蛋白质折叠的速率-长度定律

生物物理 2014-03-05 v1

摘要

我们研究了蛋白质折叠的速率-长度标度律,这是蛋白质折叠解析理论中一个尚未确定的关键标度律。我们证明链长是决定折叠时间的主导因素,并且明确确定链长与折叠时间的关联方式可以为折叠过程提供关键的机理洞察。四种特定的提议定律(幂律、指数律和两个拉伸指数律)相互进行了测试,发现幂律最能解释数据。同时,拟合的幂律得出的折叠速率非常快,在生物学背景下几乎快得不合理。我们表明所提出的任何形式都是可行的,并得出结论:要明确推断出速率-长度定律,需要更多数据,而这些数据可以通过对大蛋白质结构域进行少量蛋白质折叠实验来获得。

关键词

引用

@article{arxiv.1301.4302,
  title  = {Inferring the Rate-Length Law of Protein Folding},
  author = {Thomas J. Lane and Vijay S. Pande},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1301.4302},
  year   = {2014}
}