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作为蛋白质分子理论的Chern-Simons-Higgs模型

软凝聚态物质 2020-01-29 v2 高能物理 - 唯象学 高能物理 - 理论 生物大分子

摘要

本文讨论一种具有Chern-Simons相互作用的一维Abelian Higgs模型,作为嵌入三维空间的一维曲线的有效理论。我们论证该有效模型如何与蛋白质分子的几何相容。利用标准场论技术,我们从现象学上分析了该模型有趣的静态构型并讨论其稳定性。这一简单模型预测了蛋白质二级结构基序几何的一些特征关系,并展示其与实验数据一致。在利用数据普适地固定基本局域几何参数(如螺旋基序的曲率与挠率)后,我们仅剩一个自由参数。我们解释该参数如何控制主要基序(α螺旋、β折叠及连接它们的环)的丰度与形状。

关键词

引用

@article{arxiv.1909.01080,
  title  = {Chern-Simons-Higgs Model as a Theory of Protein Molecules},
  author = {Dmitry Melnikov and Alyson B. F. Neves},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1909.01080},
  year   = {2020}
}

备注

32 pages, 17 figures, 4 tables, references updated