规范对称性与蛋白质结构
生物大分子
2017-04-05 v1 软凝聚态物质
生物物理
摘要
我们讨论了用于蛋白质结构研究的规范场论方法，该方法提供了一种引入集体自由度和非线性拓扑结构的自然途径。我们考虑了蛋白质的局域对称性及其在介质中的破缺，从而推导出蛋白质主链的阿贝尔希格斯模型，其正确折叠由疏水力导致的规范对称性破缺定义。在该模型中，蛋白质主链的结构由一维拓扑孤子（扭结）的叠加定义，这使得我们能够以高达 1 Å 的精度重现蛋白质主链的三维结构，并预测其动力学。
引用
@article{arxiv.1703.04263,
title = {Gauge symmetries and structure of proteins},
author = {Alexander Molochkov and Alexander Begun and Antti Niemi},
journal= {arXiv preprint arXiv:1703.04263},
year = {2017}
}
备注
8 pages, 5 figures. Prepared for the proceedings of the XII Quark Confinement and the Hadron Spectrum, 29 August to 3 September 2016, Thessaloniki, Greece