基于分子结合解析模型的炼金响应参数
生物大分子
2017-07-06 v2
摘要
我们提出一种参数化的分子结合炼金解析模型。该模型准确描述了线性单解耦炼金结合自由能计算中的自由能轮廓。模型的参数具有物理动机，通过使模型预测拟合数值模拟获得。模型的有效性已在一组主客体复合物上得到评估。该模型忠实再现了结合自由能轮廓以及扰动能量作为炼金进度参数 函数的概率密度。模型为自由能轮廓的特征形状提供了合理化解释。从模型获得的参数有望成为分子复合物结合平衡的有用描述符。
引用
@article{arxiv.1707.00769,
title = {Alchemical Response Parameters from an Analytical Model of Molecular Binding},
author = {Emilio Gallicchio},
journal= {arXiv preprint arXiv:1707.00769},
year = {2017}
}