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种子库模型的一种新合并过程

概率论 2016-08-10 v3 种群与进化

摘要

我们识别出一种新的自然合并结构,称之为种子库合并过程 (seed-bank coalescent),它描述了在强种子库效应影响下种群的基因谱系,其中个体的“休眠形式”(如种子或孢子)可能在加入“活跃”种群之前跨越显著数量的世代。在数学上,如果种子休眠的平均时间与总种群大小 NN 同阶缩放,我们的种子库合并过程表现为具有几何种子库年龄结构的 Wright-Fisher 模型中的标度极限。这扩展了 Kaj、Krone 和 Lascoux [J. Appl. Probab. 38 (2011) 285-300] 的早期结果,他们表明存在“弱”种子库效应的 Wright-Fisher 模型的谱系由适当时间变换的 Kingman 合并过程给出。种子库合并过程的定性新特征是,祖先谱系以一定速率被独立地阻止参与合并事件,从而极大地改变了经典合并模型的预测。特别是,种子库合并过程“不从无穷大降下来”,且大小为 nn 的样本到达最近共同祖先的时间像 loglogn\log\log n 一样增长。这与种子库急剧增加种群遗传变异性的经验观察一致,并表明它们如何作为抵御遗传漂变和选择等其他进化力量的缓冲。

关键词

引用

@article{arxiv.1411.4747,
  title  = {A new coalescent for seed-bank models},
  author = {Jochen Blath and Adrián González Casanova and Noemi Kurt and Maite Wilke-Berenguer},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1411.4747},
  year   = {2016}
}

备注

Published at http://dx.doi.org/10.1214/15-AAP1106 in the Annals of Applied Probability (http://www.imstat.org/aap/) by the Institute of Mathematical Statistics (http://www.imstat.org)