错配修复误差蕴含查加夫第二奇偶校验规则
基因组学
2007-09-20 v2
摘要
查加夫第二奇偶校验规则在经验上适用于大多数类型的DNA，即沿DNA单链，互补碱基的含量相等，A = T，G = C。本文构建了一个马尔可夫链模型，用于追踪具备复制错配修复机制的生物体基因组单链上任意单一碱基位置的演化。在错配错误率主要取决于核苷酸氢键数量，且错配修复过程本身会产生链识别错误的关键假设下，该模型表明，任意碱基位置取4种核苷酸碱基之一的稳态概率对于互补碱基是相等的。因此，查加夫第二奇偶校验规则是大数定律作用于稳态概率的表现。更重要的是，由于该模型明确了错配修复是该规则的基础，因此它适合于实验验证。
引用
@article{arxiv.0704.2191,
title = {Mismatch Repair Error Implies Chargaff's Second Parity Rule},
author = {Bo Deng},
journal= {arXiv preprint arXiv:0704.2191},
year = {2007}
}