小世界振子网络的热力学稳定性:以蛋白质为例
生物物理
2009-05-28 v1 软凝聚态物质
生物大分子
摘要
我们通过将振子的平均均方位移与网络拉普拉斯矩阵的特征值谱联系起来,研究了小世界振子网络的振动热力学稳定性。我们表明,交叉连接有效地抑制了,并且在小世界网络上存在两个相:1)不稳定相:当时,;2)稳定相:当时,,即。这里,是小世界参数,是振子数,是交叉连接数。各种真实蛋白质结构的结果证实了这一点,它们遵循稳定相的相同标度行为。我们还表明,正是“小世界”性质在热力学稳定性中起关键作用,并导致了普适标度,而与模型细节无关。
引用
@article{arxiv.0905.1062,
title = {Thermodynamic stability of small-world oscillator networks: A case study of proteins},
author = {Jie Ren and Baowen Li},
journal= {arXiv preprint arXiv:0905.1062},
year = {2009}
}
备注
7 pages, 5 figures, accepted by Physical Review E