拓扑热不稳定性与蛋白质长度
凝聚态物理
2007-05-23 v1 q-bio
摘要
我们对全局拓扑结构对热平衡下折叠蛋白质结构稳定性在热浴中的作用进行了分析。对于广泛的单域蛋白质，我们在高斯网络模型（GNM）中计算谱图，并确定描述低频态密度行为的谱维数。我们发现谱维数与蛋白质氨基酸数目之间存在惊人的强相关性。鉴于更大的谱维数意味着折叠构象更紧凑，我们的结果表明，在给定温度和蛋白质长度下，折叠结构对应于与热力学稳定性兼容的最不紧凑的折叠形式。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0306494,
title = {Topological thermal instability and the length of proteins},
author = {R. Burioni and D. Cassi and F. Cecconi and A. Vulpiani},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0306494},
year = {2007}
}
备注
6 pages, 3 eps figures